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  2. CASENT0744589-Nomamyrmex.esenbeckii
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    Dataset: CASENT0744589-Nomamyrmex.esenbeckii

    • RADAR Metadata
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    • Technical Metadata
    Alternate identifier:
    -
    Related identifier:
    -
    Creator/Author:
    Katzke, Julian https://orcid.org/0000-0002-1447-9660 [Katzke, Julian]

    Hita Garcia, Francisco https://orcid.org/0000-0003-4709-3083 [Hita Garcia, Francisco]

    Lösel, Philipp D. https://orcid.org/0000-0003-0506-1171 [Lösel, Philipp D.]

    Faragó, Tomáš https://orcid.org/0009-0006-9824-2797 [Faragó, Tomáš]

    Economo, Evan P. https://orcid.org/0000-0001-7402-0432 [Economo, Evan P.]

    van de Kamp, Thomas https://orcid.org/0000-0001-7390-1318 [van de Kamp, Thomas]

    Azuma, Fumika https://orcid.org/0000-0002-5275-8775 [Azuma, Fumika]

    Zuber, Marcus https://orcid.org/0000-0002-2429-6171 [Zuber, Marcus]

    Hamann, Elias https://orcid.org/0000-0002-0623-9069 [Hamann, Elias]

    Sarkar, Chandan https://orcid.org/0009-0001-4374-0231 [Sarkar, Chandan]
    Contributors:
    -
    Title:
    CASENT0744589-Nomamyrmex.esenbeckii
    Additional titles:
    -
    Description:
    (Technical Remarks) Processed micro-tomographic scan of the ant Nomamyrmex esenbeckii, scanned at KIT Light Source. This dataset is part of the open-source digitization project ‘Antscan’, with a database consisting of thousands of scanned ethanol-preserved ant ... Processed micro-tomographic scan of the ant Nomamyrmex esenbeckii, scanned at KIT Light Source. This dataset is part of the open-source digitization project ‘Antscan’, with a database consisting of thousands of scanned ethanol-preserved ant samples from museums and personal collections worldwide.

    Processed micro-tomographic scan of the ant Nomamyrmex esenbeckii, scanned at KIT Light Source. This dataset is part of the open-source digitization project ‘Antscan’, with a database consisting of thousands of scanned ethanol-preserved ant samples from museums and personal collections worldwide.

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    Keywords:
    nomamyrmex esenbeckii
    antscan
    ant
    synchrotron
    micro-CT
    biology
    biodiversity
    digitization
    tomography
    insect
    formicidae
    anatomy
    Related information:
    (Domain-specific Metadata) specimen_code = CASENT0744589, collection_code = lsbf_177, taxon_code = Nomamyrmex.esenbeckii, lifestagesex_original_col = w, subcaste_original_col = not_available, caste = worker, caste_detail = not_available, genome_associated = not_available, LTS_Box = Brazil_LTS_6, for_more_specimen = not_available, specimens_left = not_available, scanning_vial_box = ANTSCAN_M_1, problems_det = not_available, problems_other = not_available, stained = unstained, scan_tray = tray_53, magnification = 2x_5steps, voxel_size = 6.11 µm, filter = 500 µm Al, projections = 3000, fps = 70.0, exposure_time_per_frame = 0.01 s, Genus = Nomamyrmex, Species = esenbeckii, Status = valid, Name = Nomamyrmex esenbeckii, Family_or_other = Formicidae, Subfamily = Dorylinae, Tribe = not_available, Genus_authority = Borgmeier, 1936, Source = https://www.antwiki.org/wiki/Nomamyrmex, specimen_id = 47676.0, located_at = OIST, owned_by = not_available, antscan_contributor = Rodrigo M. Feitosa, determined_by = not_available, insert_user_23 = fumika, collected_by = R.M. Feitosa, T.S. Silva, A.C. Ferreira, method = hand, sampling_effort = not_available, date_collected_start = 2016-09-15, date_collected_end = 2016-09-18, habitat = not_available, microhabitat = not_available, behavior = not_available, disturbance_level = not_available, country = Brazil, adm1 = Acre, adm2 = not_available, island_group = not_available, island = not_available, locality_name = Mâncio Lima, P.N. da Serra do Divisor, latitude = -7.44966944, longitude = -73.66050833, latlong_error = not_available, elevation = 245.0, elevation_error = not_available, biogeographic_region = not_available
    Language:
    English
    Publishers:
    Karlsruhe Institute of Technology(KIT)
    Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University(OIST)
    Production year:
    2025
    Subject areas:
    Biology
    Resource type:
    (Image) Dataset
    Data source:
    (Organism) Ant Specimen
    Software used:
    Resource processing
    Software:
    Python - 3.10.12
    Concert - 0.31.0
    ufo-core - 0.16
    ufo-filters - 0.16
    tofu - 0.9
    Fiji - 2.15.1
    numpy - 1.24.3
    SimpleITK - 2.3.1
    SciPy - 1.11.4
    Biomedisa - 23.09.1
    Alternative software:
    -
    Data processing:
    Tomographic data acquisition
    Reconstruction of absorption and phase contrast 32-bit tomograms
    Blending of both reconstructions
    8-bit conversion
    Stitching of height steps
    Cropping
    Publication year:
    2025
    Rights holders:
    Karlsruhe Institute of Technology(KIT)

    Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University(OIST)
    Funding:
    BMBF (05K2019 & 05K2022)
    DFG (INST 35/1503-1 FUGG)
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    Name Storage Metadata Upload Action
    Status:
    Published
    Uploaded by:
    radarips
    Created on:
    2024-09-17
    Archiving date:
    2025-05-12
    Archive size:
    2.7 GB
    Archive creator:
    radarips
    Archive checksum:
    3b3474e0dc160b6cf6a11afab7456d4c (MD5)
    Embargo period:
    -
    DOI: 10.35097/q8gy3evm2zp8dnxf
    Publication date: 2025-05-12
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    Download (2.7 GB)

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    This work is licensed under
    CC BY 4.0
    CC icon
    Cite Dataset
    Katzke, Julian; Hita Garcia, Francisco; Lösel, Philipp D.; et al. (2025): CASENT0744589-Nomamyrmex.esenbeckii. Karlsruhe Institute of Technology(KIT); Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University(OIST). DOI: 10.35097/q8gy3evm2zp8dnxf
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    1.22.9 (f) / 1.16.2 (b) / 1.22.4 (i)

    RADAR4KIT ist ein über das Internet nutzbarer Dienst für die Archivierung und Publikation von Forschungsdaten aus abgeschlossenen wissenschaftlichen Studien und Projekten für Forschende des KIT. Betreiber ist das Karlsruher Institut für Technologie (KIT). RADAR4KIT setzt auf dem von FIZ Karlsruhe angebotenen Dienst RADAR auf. Die Speicherung der Daten findet ausschließlich auf IT-Infrastruktur des KIT am Steinbuch Centre for Computing (SCC) statt.

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